根據(jù)臨床表現(xiàn)和多導(dǎo)眠記錄儀的監(jiān)護結(jié)果即可對這幾種類型的睡眠呼吸紊亂做出明確診斷，有時需與其它疾病如肺心病，睡眠呼吸紊亂樣現(xiàn)象相鑒別。

需要注意的是盡管健康人REM睡眠時相呼吸較規(guī)則，但在睡眠開始時也可見到幾分鐘的呼吸不穩(wěn)定時期，到穩(wěn)定睡眠后就消失。這一時期看到的呼吸暫停不存在呼吸運動，易被誤認為CSAS。無癥狀的健康人也可出現(xiàn)阻塞性睡眠呼吸暫停，但通常每晚少于20次，僅有輕度動脈血氧飽和度降低。如果發(fā)生在REM睡眠時相，由于喚醒反應(yīng)減弱，可導(dǎo)致明顯的動脈血氧飽和度下降。

此外，易與睡眠呼吸暫停綜合征混淆的呼吸暫停樣現(xiàn)象有以下二種：①癲癇 沒有緊張陣攣的輕度癲癇也可存在呼吸暫停。如發(fā)生在睡眠時或睡眠樣的發(fā)作后狀態(tài)可與睡眠呼吸暫停混淆，可借助腦電圖鑒別。②陳-施氏呼吸 可見于心輸出量減少或循環(huán)時間延長的患者，以及影響呼吸中樞的各種神經(jīng)系統(tǒng)疾病和一些老年。很難與中樞性呼吸暫停區(qū)別，而且兩者可并存。但陳-施氏呼吸的呼吸幅度變化緩和，從小到大，然后變小至呼吸暫停，呼吸暫停時間較短。中樞性呼吸暫停傾向于突然發(fā)生，常合并喚醒反應(yīng)，呼吸暫停時間較長，可達60s。此外，陳-施氏 呼吸可持續(xù)到清醒狀態(tài)，而中樞性呼吸暫停在清醒時不出現(xiàn)，并且常在REM睡眠時加重。

OSAS也可與CSAS，肥胖低通氣綜合征、上氣道阻力綜合征共同存在或獨立發(fā)生。但單純的OSAS病人在清醒狀態(tài)通常無高碳酸血癥，而肥胖低通氣綜合征即使白天的PaCO2也常高于45mmHg。

慢阻塞性肺病患者睡眠時可伴有明顯的呼吸和氣體交換功能惡化，主要是嚴重的動脈血氧飽和度降低及合并短暫特異性呼吸異常，如呼吸暫停和呼吸不足。在REM睡眠時相最明顯，其機制尚不清楚，可能與該睡眠時相伴有的呼吸活動異常有關(guān)。另外，這些患者清醒時即存在化學通氣反應(yīng)遲鈍，睡眠時可進一步加重，減少通氣反應(yīng)。此種情況是否診斷睡眠呼吸紊亂及如何命名尚無一致意見。